การออกแบบ Workflow สำหรับระบบ Multi-Agent ในงานวิทยาศาสตร์นั้นมีความยาก เนื่องจากขาดชุดข้อมูลฝึกฝนที่เป็นมาตรฐาน และมีอินเทอร์เฟซที่แตกต่างกันระหว่างเครื่องมือ AgentCo-op จึงถูกพัฒนาขึ้นเพื่อแก้ปัญหานี้โดยใช้แนวทางการสังเคราะห์แบบสืบค้น ซึ่งสามารถนำทักษะ เครื่องมือ และ Agent จากภายนอกมาประกอบเข้าด้วยกันเป็นขั้นตอนการทำงานที่รันได้จริง
ระบบนี้ใช้การส่งต่อข้อมูลแบบ Typed Artifact และมีกลไกการซ่อมแซมตัวเองเฉพาะจุด (Local Repair) เมื่อเกิดข้อผิดพลาดในการรัน จากการทดสอบในกรณีศึกษาด้านพันธุศาสตร์ (Genomics) พบว่า AgentCo-op สามารถประสานงาน Agent เฉพาะทางเพื่อวิเคราะห์ข้อมูลที่ซับซ้อนได้โดยไม่ต้องออกแบบโครงสร้างใหม่ทั้งหมด นอกจากนี้ยังทำคะแนนได้ดีเยี่ยมในเบนช์มาร์กด้านการเขียนโค้ดและคณิตศาสตร์ พร้อมลดต้นทุนต่อการทำงานลงได้