เป็นเวลานานที่นักวิทยาศาสตร์เชื่อว่ามนุษย์ปัจจุบันมีดีเอ็นเอของนีแอนเดอร์ทัลจากการผสมข้ามสายพันธุ์เมื่อ 45,000 ปีก่อน ทว่าในปี 2024 นักพันธุศาสตร์ประชากรชาวฝรั่งเศส Lounès Chikhi และ Rémi Tournebize ได้เสนอทางเลือกใหม่ว่า หลักฐานทางพันธุกรรมเหล่านั้นอาจเป็นผลมาจาก 'โครงสร้างประชากร' (Population Structure) ในแอฟริกา
ข้อโต้แย้งหลักคือ แบบจำลองคอมพิวเตอร์ที่ใช้ในอดีตตั้งอยู่บนสมมติฐานว่ามนุษย์ผสมพันธุ์แบบสุ่มในกลุ่มประชากรขนาดใหญ่ แต่หลักฐานทางโบราณคดีชี้ว่ามนุษย์ในอดีตอยู่กันเป็นกลุ่มย่อยที่ถูกตัดขาดด้วยสภาพภูมิศาสตร์ ซึ่งความซับซ้อนนี้อาจทำให้เกิดรูปแบบจีโนมที่คล้ายกับนีแอนเดอร์ทัลได้โดยไม่จำเป็นต้องมีการผสมข้ามสายพันธุ์ เรื่องนี้ชี้ให้เห็นถึงความสำคัญของคุณภาพแบบจำลองทางสถิติในการตีความข้อมูลดิบทางวิทยาศาสตร์
